Algorithme du filtrage

Sachant:Diag = ( Sd, Hd, Cd), Motif = (T, Hp, Cp)

T= I0-V1-I1-V2- ... - Ik-1 - Vk-Ik

Sp= V1,V2, …,Vk

Etablir une correspondance entre les nombres des séquences

Sd et Sp et les contraintes:

(1) 1 ? Sp ? |Sd|

(2) Spj+1 = Spj + Ij + 1

Alors
• Hp ? Hd sous-ensemble Liaison hydrogene
• Cp ? Cd sous-ensemble Chiralités
• Sp ? Sd subsequence ESS

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