Motivation
Diagrammes TOPS (“croquis”) - projection optimale de structures tri-dimensionnelles de protéines en 2 dimensions.
Comparaison manuelle et compréhension des repliements de protéines.
A l ’origine, dessinés à la main
Maintenant production automatique des croquis à partir de la banque de données “Brookhaven Protein Data Bank” (PDB)
Atlas en-ligne, recherche par nom de protéine.
- besoin de definir les motifs cibles & de rechercher les domaines correspondants dans la base de données
- comparaison des structures de protéines