cpn  [levchenko]
{
constants:
  valuesets[Main:V_Set_1:V_Set_2:V_Set_3]
marking:
  double n_Raf = [4:8:40:400];
  double n_RasGTP = [1:2:10:100];
  double n_ERK = [3:6:30:300];
  double n_Phase2 = [2:4:20:200];
  double n_Phase3 = [3:6:30:300];
  double n_MEK = [2:4:20:200];
  double n_Phase1 = [3:6:30:300];
parameter:
  double k1 = [1.0:::];
  double k10 = [3.3:::];
  double k4 = [0.5:::];
  double k3 = [0.1:::];
  double k6 = [0.1:::];
  double k7 = [3.3:::];
  double k8 = [0.42:::];
  double k9 = [0.1:::];
  double k2 = [0.4:::];
  double k21 = [0.1:::];
  double k22 = [20.0:::];
  double k23 = [0.6:::];
  double k24 = [0.1:::];
  double k25 = [5.0:::];
  double k26 = [0.4:::];
  double k27 = [0.1:::];
  double k28 = [5.0:::];
  double k29 = [0.4:::];
  double k30 = [0.1:::];
  double k11 = [0.4:::];
  double k12 = [0.1:::];
  double k13 = [10.0:::];
  double k14 = [0.8:::];
  double k15 = [0.1:::];
  double k16 = [10.0:::];
  double k17 = [0.8:::];
  double k18 = [0.1:::];
  double k19 = [20.0:::];
  double k20 = [0.6:::];
  double sf = [0.1:0.05:0.01:0.001];
  double k5 = [0.5:::];

places:
continuous:
   Raf = n_Raf;
   RasGTP = n_RasGTP;
   Raf_RasGTP = 0;
   RafP = 0;
   RafP_Phase1 = 0;
   MEK_RafP = 0;
   MEKP_RafP = 0;
   MEKP_Phase2 = 0;
   MEKPP_Phase2 = 0;
   ERK = n_ERK;
   ERK_MEKPP = 0;
   ERKP_MEKPP = 0;
   ERKP = 0;
   MEKPP = 0;
   ERKPP_Phase3 = 0;
   ERKP_Phase3 = 0;
   MEKP = 0;
   ERKPP = 0;
   Phase2 = n_Phase2;
   Phase3 = n_Phase3;
   MEK = n_MEK;
   Phase1 = n_Phase1;

transitions:
continuous:
  _TC_0_k3
    : 
    : [RafP + 1] & [RasGTP + 1] & [Raf_RasGTP - 1]
    : k3 * Raf_RasGTP
    ;
  _TC_1_k6
    : 
    : [Raf + 1] & [Phase1 + 1] & [RafP_Phase1 - 1]
    : k6 *RafP_Phase1
    ;
  _TC_2_k21
    : 
    : [ERKP + 1] & [MEKPP + 1] & [ERK_MEKPP - 1]
    : k21 *ERK_MEKPP
    ;
  _TC_3_k18
    : 
    : [MEK + 1] & [Phase2 + 1] & [MEKP_Phase2 - 1]
    : k18 * MEKP_Phase2
    ;
  _TC_4_k9
    : 
    : [MEKP + 1] & [RafP + 1] & [MEK_RafP - 1]
    : k9 * MEK_RafP
    ;
  _TC_5_k12
    : 
    : [MEKPP + 1] & [RafP + 1] & [MEKP_RafP - 1]
    : k12 * MEKP_RafP
    ;
  _TC_6_k15
    : 
    : [Phase2 + 1] & [MEKP + 1] & [MEKPP_Phase2 - 1]
    : k15 * MEKPP_Phase2
    ;
  _TC_7_k24
    : 
    : [ERKPP + 1] & [MEKPP + 1] & [ERKP_MEKPP - 1]
    : k24 * ERKP_MEKPP
    ;
  _TC_8_k1
    : 
    : [Raf_RasGTP + 1] & [Raf - 1] & [RasGTP - 1]
    : k1 * Raf* RasGTP* sf
    ;
  _TC_9_k2
    : 
    : [RasGTP + 1] & [Raf + 1] & [Raf_RasGTP - 1]
    : k2 * Raf_RasGTP
    ;
  _TC_10_k27
    : 
    : [Phase3 + 1] & [ERKP + 1] & [ERKPP_Phase3 - 1]
    : k27 * ERKPP_Phase3
    ;
  _TC_11_k30
    : 
    : [ERK + 1] & [Phase3 + 1] & [ERKP_Phase3 - 1]
    : k30 * ERKP_Phase3
    ;
  _TC_12_k16
    : 
    : [MEKP_Phase2 + 1] & [Phase2 - 1] & [MEKP - 1]
    : k16 * Phase2 * MEKP *sf
    ;
  _TC_13_k17
    : 
    : [Phase2 + 1] & [MEKP + 1] & [MEKP_Phase2 - 1]
    : k17 * MEKP_Phase2
    ;
  _TC_14_k29
    : 
    : [Phase3 + 1] & [ERKP + 1] & [ERKP_Phase3 - 1]
    : k29 * ERKP_Phase3
    ;
  _TC_15_k28
    : 
    : [ERKP_Phase3 + 1] & [Phase3 - 1] & [ERKP - 1]
    : k28 * Phase3 * ERKP * sf
    ;
  _TC_16_k14
    : 
    : [Phase2 + 1] & [MEKPP + 1] & [MEKPP_Phase2 - 1]
    : k14 * MEKPP_Phase2
    ;
  _TC_17_k13
    : 
    : [MEKPP_Phase2 + 1] & [Phase2 - 1] & [MEKPP - 1]
    : k13 * Phase2 * MEKPP * sf
    ;
  _TC_18_k5
    : 
    : [Phase1 + 1] & [RafP + 1] & [RafP_Phase1 - 1]
    : k5 * RafP_Phase1
    ;
  _TC_19_k4
    : 
    : [RafP_Phase1 + 1] & [Phase1 - 1] & [RafP - 1]
    : k4 * Phase1 * RafP * sf
    ;
  _TC_20_k26
    : 
    : [Phase3 + 1] & [ERKPP + 1] & [ERKPP_Phase3 - 1]
    : k26 * ERKPP_Phase3
    ;
  _TC_21_k25
    : 
    : [ERKPP_Phase3 + 1] & [Phase3 - 1] & [ERKPP - 1]
    : k25 * Phase3 * ERKPP * sf
    ;
  _TC_22_k11
    : 
    : [RafP + 1] & [MEKP + 1] & [MEKP_RafP - 1]
    : k11 * MEKP_RafP
    ;
  _TC_23_k8
    : 
    : [RafP + 1] & [MEK + 1] & [MEK_RafP - 1]
    : k8 * MEK_RafP
    ;
  _TC_24_k23
    : 
    : [MEKPP + 1] & [ERKP + 1] & [ERKP_MEKPP - 1]
    : k23 * ERKP_MEKPP
    ;
  _TC_25_k20
    : 
    : [MEKPP + 1] & [ERK + 1] & [ERK_MEKPP - 1]
    : k20 * ERK_MEKPP
    ;
  _TC_26_k7
    : 
    : [MEK_RafP + 1] & [RafP - 1] & [MEK - 1]
    : k7 * RafP * MEK * sf
    ;
  _TC_27_k10
    : 
    : [MEKP_RafP + 1] & [RafP - 1] & [MEKP - 1]
    : k10 * RafP*MEKP*sf
    ;
  _TC_28_k19
    : 
    : [ERK_MEKPP + 1] & [MEKPP - 1] & [ERK - 1]
    : k19 * MEKPP*ERK * sf
    ;
  _TC_29_k22
    : 
    : [ERKP_MEKPP + 1] & [MEKPP - 1] & [ERKP - 1]
    : k22 * MEKPP * ERKP * sf
    ;

}